當前重組蛋白的生產主要有四大系統;1.原核表達系統，zui常用的大腸桿菌蛋白表達；真核表達系統如酵母；哺乳動物細胞蛋白表達（常用的細胞CHO，HEK293）；昆蟲細胞蛋白表達系統。目前重組蛋白在制藥工業上主要是指表達獲得的細胞因子、凝血因子或者人工設計的蛋白分子。

根據不同的分類標準，可以將重組蛋白分為不同的類別：

按功能分，可分為以下幾種：
　 1.白細胞介素（Interleukin，IL）
　　由多種細胞產生并作用于多種細胞的一類細胞因子，由于zui初是由白細胞產生且又在白細胞間發揮作用，所以得名，現仍沿用此名。
　 2.干擾素（interferon，IFN）
　　具有干擾病毒復制的能力，因此的名號。其具有十分廣泛的生物活性，在免疫應答和免疫調節中發揮重要作用，也是主要的促炎細胞因子之一。　

   3.腫瘤環死因子tumor necrosis factor,TNF）
　　由于在體內外均可直接殺傷腫瘤細胞故得名。其家族成員約有30個。
　 4.集落刺激因子（colony stimulating factor，CSF）
　　一組在體內外均可選擇性刺激造血祖細胞增殖、分化并形成某一譜系細胞集落的細胞因子，包括巨噬細胞CSF、粒細胞CSF、巨噬細胞/粒細胞CSF、干細胞因子等。
　　5.生長因子（growth factor，GF）
　　一類可介導不同類型細胞生長和分化的細胞因子，根據其功能和所作用細胞的不同，分別命名為轉化生長因子（TGF）、神經生長因子（NGF）、表皮生長因子（EGF）、血管內皮細胞生長因子（VEGF）、成纖維細胞生產因子（FGF）等。
　　6.趨化性細胞因子（chemokine）
　　一類對不同靶細胞具有趨化效應的細胞因子家族，可由白細胞和某些組織細胞分泌，是一個包括60多個成員的蛋白質家族。